Ajoutez ( ou créez s'il n'existe pas ) au fichier /etc/mk.conf :

CFLAGS+=-O2 -march=i686 -mcpu=i386
CXXFLAGS=-O2 -march=i686 -mcpu=i386
COPTS+=-O2 -mcpu=i686 -fexpensive-optimizations -ffast-math -msoft-float \
       -fmemoize-lookups -fthread-jumps  -fomit-frame-pointer \
       -finline-functions

afin que les compilations qui ont lieu sur votre système collent à la peau de votre archi et subissent un minimum d'optimisation. Les compilations concernées sont :

• le noyau
• le source tree
• les pkgsrc

Remplacez i686 par votre type d'architecture si besoin.

Update: merci pour les corrections postées dans les commentaires.